蕎麥茶的副作用通常有過敏、消化不良、誘發低血糖等，建議患者對癥治療。
1.過敏：過敏是指人體接觸某些物質后發生的過度免疫反應，如果對蕎麥茶中的成分過敏，可能會出現皮膚瘙癢、風團、鼻塞等癥狀。建議不要再喝蕎麥茶，并且按照醫囑使用鹽酸西替利嗪片、富馬酸酮替芬片、馬來酸氯苯那敏片等藥物進行治療。
2.消化不良：蕎麥茶的主要成分為蕎麥，蕎麥味甘、性涼，通常不宜多吃，如果過量飲用蕎麥茶，可能會導致消化不良，進而出現反胃、嘔吐等不適。建議患者按照醫囑使用健胃消食片、復方消化酶片、多潘立酮片等藥物治療。
3.誘發低血糖：如果平時過量的飲用蕎麥茶，可能會使體內血糖就會快速的降低，進而誘發低血糖，出現心悸、焦慮等情況。患者可以按照醫囑使用鹽酸米多君片、生脈顆粒、歸脾丸等藥物進行治療。
過量喝蕎麥茶還可能會誘發胃部疾病。