咪喹莫特乳膏和維A酸乳膏在去疣方面各有優勢，不能簡單判定哪個更好，患者應在醫生的指導下用藥。
咪喹莫特乳膏主要通過誘導局部細胞因子的產生，激活免疫細胞，從而發揮抗病毒及抗腫瘤作用，對尖銳濕疣等病毒感染性疣有較好療效。咪喹莫特乳膏通常能夠刺激機體自身的免疫系統來清除疣體，在治療過程中，除了直接作用于疣體，還可以增強局部的免疫監視，減少疣體復發的可能性。維A酸乳膏主要是調節表皮細胞的分化和增殖，使角質層細胞疏松而容易脫落，去除疣體的同時，可改善皮膚的角化異常情況。
患者的用藥部位應保持清潔干燥，避免接觸眼睛、口腔等黏膜部位。在使用過程中，如果出現局部紅腫、疼痛、瘙癢加劇、破潰等不良反應，患者應立即停藥。