婦科囊腫有可能自己消失，也可能不會，這取決于囊腫的類型。
常見的婦科囊腫有卵巢囊腫和宮頸囊腫等。對于一些生理性的卵巢囊腫，如濾泡囊腫和黃體囊腫，多在月經周期中出現。濾泡囊腫是卵泡發育過程中未破裂或閉鎖而形成的，一般直徑小于5厘米，多數可在2-3個月經周期內自行消失。黃體囊腫則是在黃體形成過程中出現問題而產生，通常在下次月經來潮后也可能自行萎縮。這是因為隨著月經周期的激素變化，囊腫失去了持續生長的條件。
然而，病理性的卵巢囊腫，如囊腺瘤等，不會自行消失。卵巢子宮內膜異位囊腫是子宮內膜異位癥的一種表現，異位的子宮內膜在卵巢內周期性出血，形成囊腫，會隨著月經周期反復出血、增大。囊腺瘤則是卵巢的良性腫瘤，會持續存在且可能逐漸增大。宮頸囊腫多是由于宮頸腺管口狹窄或阻塞，導致腺體分泌物引流受阻形成的潴留囊腫，一般不會自行消失，但如果囊腫較小且無癥狀，通常不需要特殊處理。
如果發現婦科囊腫，不要自行判斷。應及時就醫，醫生會通過超聲檢查、腫瘤標志物檢測等方法判斷囊腫類型、大小、位置等。如果是生理性囊腫，可定期復查觀察其變化；如果是病理性囊腫，醫生會根據具體情況制定合適的治療方案，如藥物治療或手術治療。