陰囊根部有小疙瘩可能是陰囊濕疹、毛囊炎、皮脂腺囊腫、股癬、疥瘡結節等因素引起的，建議患者及時前往正規醫院就診檢查，通過日常護理、藥物治療的方式進行處理。
1、陰囊濕疹：陰囊部位長期處于潮濕環境，或接觸到某些過敏原，可能會引發陰囊濕疹，出現紅斑、丘疹、小疙瘩等，往往伴有瘙癢。處理方式是保持陰囊部位清潔干燥，避免搔抓。藥物治療方面，患者可在醫生指導下使用糠酸莫米松乳膏、曲安奈德益康唑乳膏、復方黃柏液涂劑等藥物。
2、毛囊炎：陰囊根部毛囊受到細菌感染，會出現毛囊炎，表現為毛囊周圍的紅腫、小疙瘩，可能伴有疼痛。患者平時要注意個人衛生，同時可在醫生指導下外用莫匹羅星軟膏、夫西地酸乳膏、紅霉素軟膏等藥物。
3、皮脂腺囊腫：陰囊皮膚內的皮脂腺排泄管阻塞，皮脂腺囊狀上皮被逐漸增多的內容物膨脹，就形成了皮脂腺囊腫，表現為圓形的小疙瘩，質地較硬。如果沒有感染，一般無需特殊處理，注意觀察即可。若出現感染，患者可在醫生指導下服用阿莫西林膠囊、頭孢呋辛酯片、甲硝唑片等藥物。
4、股癬：股癬由真菌感染引起，除了有小疙瘩，還常有紅斑、脫屑，伴有明顯瘙癢。患者要注意內衣褲的消毒，同時可在醫生指導下使用硝酸咪康唑乳膏、鹽酸特比萘芬乳膏、克霉唑乳膏等藥物。
5、疥瘡結節：疥螨感染后，在陰囊部位可形成疥瘡結節，表現為質硬的小疙瘩，瘙癢劇烈。患者通常需要在醫生的指導下外用硫軟膏、克羅米通乳膏、林旦乳膏等藥物。
此外，患者要注意保持陰囊部位的清潔衛生，穿著寬松透氣的內褲，避免搔抓和摩擦，以促進病情的恢復。