感染幽門螺桿菌以后，大多數人群沒有明顯的臨床癥狀，部分人群需給予幽門螺桿菌的根除治療。因為幽門螺桿菌是定植在人類胃黏膜上的一種桿菌，毒力和致病性都非常強，并且會引起臨床相關疾病，常見的如慢性活動性胃炎、消化性潰瘍，甚至胃癌等，需引起重視。
由于幽門螺桿菌比較頑固，根除幽門螺桿菌需要兩種以上抗菌藥物聯合應用，并且需同時給予質子泵抑制劑降低胃酸，改善胃內微環境。選用的抗生素要在醫生指導下，根據當地抗生素耐藥情況來選擇，一般療程為2周，停藥1個月后進行復檢。
幽門螺桿菌根除治療常用四聯方案，包括一種鉍劑、一種質子泵抑制劑，以及兩種抗菌藥物，其中鉍劑包括膠體果膠鉍、枸櫞酸鉍鉀，質子泵抑制劑包括奧美拉唑、蘭索拉唑、泮托拉唑、雷貝拉唑，以及埃索美拉唑等。抗菌藥物包括阿莫西林、紅霉素、克拉霉素、甲硝唑、替硝唑等。