女性在藥流后第三天出現小腹疼的情況，這可能是子宮收縮所引起，屬于正常的情況。但也并不排除是由于盆腔炎癥、胃腸炎癥等原因所致，建議可前往醫院就診檢查，以便明確病因后進行針對性治療。
1、子宮收縮：藥流是通過藥物軟化宮頸，并增加子宮敏感性促進子宮收縮，繼而將孕囊排出體外達到終止妊娠的效果。而這種收縮可能會造成小腹疼的癥狀，一般可持續一周左右，由于個體差異不同，出現疼痛的時間可能不會一直持續，此時也可能在藥物流產后第三天出現；
2、盆腔炎癥：藥物流產后身體本就較為虛弱，而若不注意局部衛生護理，在藥物流產后第三天進行盆浴，其中的污水即可通過生殖道進入盆腔，繼而可引起盆腔炎癥。而在炎癥刺激下，即可出現小腹疼痛的癥狀，并可伴隨陰道異常流血、分泌物增多、月經失調等癥狀；
3、胃腸炎：若是在藥流第三天后進食不潔食品，而誘發胃腸炎，而在炎癥刺激下引起腸道痙攣，繼而可造成小腹疼痛的現象，可伴有腹瀉、腹脹、惡心等癥狀。