頭疼可能會引起牙疼，但需要注意的是這里所謂的引起牙疼并非牙齒方面疾病產生的疼痛，比如牙髓炎、牙周炎等。而是指頭疼發作時，有時可向牙齒部位輻射，引起牙齒放射性疼痛，而被誤以為是牙疼，甚至誤被當成口腔疾病進行治療。一般臨床上多見于三叉神經痛、偏頭痛引起的頭疼。
1、三叉神經痛：是由于三叉神經附近的責任血管侵犯、壓迫三叉神經導致三叉神經核興奮性增高，而且反復異常放電，從而導致三叉神經分布的區域內反復出現疼痛，也會引起頭疼。而且疼痛性質較為劇烈，呈刀割樣、撕裂樣、電擊樣疼痛，有時會伴發咀嚼肌無力、咬合困難、面部感覺減退等。當疼痛長期反復發作時，會導致患者頜面部皮膚粗糙、面部腫脹，常會被誤診為口腔疾病所引起的牙疼。但檢查時可發現無明顯的牙齦腫痛、牙齒叩擊痛等特征性改變。三叉神經痛患者一般可通過口服止痛藥物、針灸以及采取微血管減壓手術等方式進行治療；
2、偏頭痛：有很多偏頭痛患者疼痛發作時癥狀不典型，會出現一側顳部、頜面部隱隱作痛，疼痛性質多為持續性鈍痛。這與牙疼的癥狀相似，因此有時會被誤診。但當疼痛性質逐漸加劇時，就會演變為較為嚴重的搏動性頭疼，常伴有惡心、嘔吐，對聲音和光線敏感。嚴重者甚至可能出現視物模糊、暈厥，偏頭痛的治療主要是通過藥物和心理疏導等方式來緩解。