腸結核和克羅恩病相比，克羅恩病相對更嚴重，大致可以從病因、治療和預后等方面進行分析。但無論是哪種病，患者均需盡早進行積極的治療，否則有可能由于病情進展，而導致腸梗阻、腸穿孔、壞死等嚴重后果。
1、病因：克羅恩病是指不明原因的腸道炎癥疾病，病因可能與免疫、感染(細菌、病毒或支原體) 、遺傳、精神因素及食物過敏或吸煙等因素有關，在任何年齡段均可發病。而腸結核是由結核分枝桿菌引起的腸道慢性特異性炎癥，常發生于中青年。由于克羅恩病的病因復雜、患者年齡跨度大，因此臨床上克羅恩病比腸結核的治療更復雜、病情更嚴重；
2、治療：克羅恩病的發病率較低，藥物研發、制造或引進缺乏動力，導致臨床治療藥物較稀缺。并且克羅恩病可能影響到消化道的各個部分，累及整個腸壁，還可能出現跳躍性的病變，因此手術較復雜。而腸結核通常使用常規抗結核藥或結合手術即可達到臨床治愈效果。因此，相較而言，克羅恩病比腸結核的治療難度大且難以根治；
3、預后：克羅恩病可受到精神、食物等多種因素影響而反復發作、病情病程長，而腸結核在消除結核分枝桿菌等治療后即可痊愈。因此，克羅恩病與腸結核相比，易復發且病程長。
綜上可知，克羅恩病比腸結核更嚴重，但腸結核也需及時治療，否則也可能出現腸穿孔、腸出血、急性腹膜炎等嚴重不良后果。