嬰兒床用棉被當床墊的危害主要在于影響睡眠質量、影響骨骼發育，也有可能會造成窒息。因此，家長不要圖方便給嬰兒選擇用棉被當床墊。
1、影響睡眠質量：棉被當床墊使用，由于過于柔軟，會造成嬰兒背部肌肉無法得到充分地舒展，嬰兒睡覺的時候經常會被驚醒，從而影響嬰兒睡眠質量；
2、影響骨骼發育：嬰兒的年齡較小，骨骼脊柱等都未發育完全，這時如果選擇了較為柔軟的棉被當床墊使用，嬰兒會由于棉被太軟導致脊柱、骨骼的發育變形；
3、造成窒息：棉被通常比較軟，對于一個剛學會翻身的嬰兒來說，用棉被當床墊是比較危險的，因為這時嬰兒有可能從仰臥位翻成俯臥位但不能再翻回來，這時由于棉被十分柔軟，容易把嬰兒的口鼻捂住，很容易造成嬰兒窒息的情況發生。
嬰兒床要選擇軟硬程度適中、材質柔軟親膚的床墊，同時在嬰兒睡覺時也要盡量確保嬰兒仰臥，胸部或頸部以上盡量不要覆蓋毛毯或被子，避免嬰兒睡眠中出現意外。