兒童神經科治療的疾病主要包括兩大方面，即感染性中樞神經系統疾病、非感染性中樞神經系統疾病。常見的感染性中樞神經系統疾病如腦炎、感染性脊髓炎或周圍神經炎；常見的非感染性中樞神經系統疾病有周圍神經病變、癲癇、遺傳代謝性疾病、行為異常性疾病等。
一、感染性中樞神經系統疾病：1、腦炎：包括各種類型的腦炎、腦膜炎，如病毒性、細菌性、真菌性等；
2、感染性脊髓炎或周圍神經炎：比如急性播散性腦脊髓膜炎、橫斷性脊髓炎，或者格林-巴利綜合征。
二、非感染性中樞神經系統疾病：1、周圍神經病變：如面神經麻痹、前庭神經元炎，或者末梢神經炎癥；
2、癲癇：抽搐發作、各種類型的癲癇或者癲癇綜合征，均屬于兒童神經科治療的范疇；
3、遺傳代謝性疾病：兒童神經科還可以治療存在神經系統癥狀的遺傳代謝性疾病，比如肝豆狀核變性、甲狀腺減低癥、粘多糖病等，還有中樞神經系統的發育遲緩患者，比如小兒腦癱；
4、行為異常性疾?。喝鐑和^常見的注意缺陷多動障礙、抽動障礙，或者抽動穢語綜合征等。
除以上疾病外，神經肌肉接頭的病變也屬于兒童神經科治療的范疇，如重癥肌無力。兒童神經科治療的疾病還包括肌肉病變，比如進行性肌營養不良、腦瘤等。
如果兒童出現以上疾病，可以到兒童神經科進行治療，如果不清楚是否屬于此科室診治的范圍，建議先打電話咨詢工作人員，然后到相關科室就診。建議家長及時帶領出現神經癥狀的患兒就診，因為神經細胞出現損傷后通常不可再生，如果錯過最佳治療時間，可能會導致兒童出現功能障礙，而無法恢復正常。