服用佐匹克隆一般會出現困倦、口苦、口干、肌無力、頭痛等副作用，右佐匹克隆副作用主要表現為口苦、頭暈、瞌睡、乏力、惡心、嘔吐等。出現不良反應可通過減少服藥量來解決，也可換用其他藥物，長期服用的患者，停藥時須在醫生的指導下逐漸減少藥量。具體情況如下：
1、佐匹克隆有助于睡眠，但是會對自身身體造成一定的傷害，最常見的初始癥狀是口干舌燥、四肢無力等。有時會產生健忘的現象，除此之外，長期服用時，會感到明顯興奮和焦慮。此外當睡覺時，可能會出現顫抖，甚至再次失眠，這些情況會在緩慢停藥后消失。
2、右佐匹克隆是一種二類精神藥物，常用于治療失眠。服用右佐匹克隆會導致副作用，長期服用右佐匹克隆片會產生依賴，還會導致中樞系統的神經癥狀，如嗜睡、疲勞、抑郁，以及頭暈和健忘等。
以下人群禁止服用佐匹克隆和右佐匹克隆：對其成分過敏者、呼吸功能不全者、重癥肌無力患者、重癥睡眠呼吸暫停綜合征等患者。服用佐匹克隆和右佐匹克隆后患者禁止攝入酒精性飲品，不適宜操作機器、開車，宜少吃辛辣等。否則會出現副作用。