吃巧克力肚子疼通常是因為本身有淺表性胃炎、腸炎、胃食管反流病等原因導致，具體原因需要到醫院進行詳細檢查，然后注意自身護理，避免病情加重。
1、淺表性胃炎：通常是患者感染了病菌等因素引起，也有可能是患者經常服用刺激腸胃的藥物等因素所致，會使患者出現胃部疼痛以及惡心、嘔吐等癥狀。如果患者大量吃巧克力，巧克力中的部分刺激成分可能會刺激局部黏膜，造成吃巧克力肚子疼。建議遵醫囑使用奧美拉唑腸溶膠囊、艾司奧美拉唑鎂腸溶片等藥物保護胃黏膜，以緩解肚子疼的癥狀；
2、腸炎：主要是患者平時不良的飲食習慣等因素引起，會導致患者出現腹瀉、惡心等癥狀，并且患者大量吃巧克力，很有可能會刺激到局部炎癥，從而造成吃巧克力肚子疼。建議遵醫囑做腸鏡明確情況，疼痛明顯時可以遵醫囑使用硫酸阿托品片、硫酸阿托品注射液等藥物緩解癥狀；
3、胃食管反流：可能與飲食刺激、精神壓力等因素有關，會導致患者出現反酸、打嗝等癥狀，本身就很容易導致患者出現肚子疼的現象。如果患者在此時吃巧克力，就很有可能會加重這種狀況，引發吃巧克力肚子疼。建議平時吃完東西不要立即平躺，平時少吃咖啡、濃茶、巧克力等含有刺激成分的食物。建議遵醫囑使用雷貝拉唑鈉腸溶片、艾司奧美拉唑鎂腸溶片等藥物減少胃酸分泌，從而緩解肚子疼；
除此以外，如果巧克力變質或患者對巧克力過敏，以及患者存在胃酸分泌過多、十二指腸潰瘍等因素也會引發吃巧克力肚子疼。建議平時要盡量少食多餐，不要暴飲暴食，也要少吃一些巧克力，并注意保持心情愉快。