16歲男生臉上長毛屬于青春期發育的一種正常現象，一般不需要采取任何措施進行處理，但如果毛發生長的速度過快，需要去醫院的皮膚科就診，明確病因后在醫生指導下治療。
1、一般不需要處理：16歲男生正處于青春期，屬于生長發育的快速時期，身體中的激素水平也會發生比較大的改變，荷爾蒙和雄激素分泌的量比較多，刺激身體迅速長高，也會出現第二性征快速發育的情況，常見表現是出現喉結、長胡子、聲音變得粗厚低沉，睪丸也開始發育，臉部皮膚油脂分泌增多等，屬于正常生理現象。如果臉上長毛只是單純在胡子部位，一般不需要采取措施進行處理；
2、去醫院就診：如果整個臉部的毛發生長都特別茂密，需要考慮是否存在高雄激素性多毛癥，可以去醫院的皮膚科或者內分泌科就診，在醫生指導下使用抑制腎上腺皮質增生的藥物進行治療，如潑尼松或地塞米松，也可以等16歲男生成年后通過激光脫毛術的方式治療，能夠幫助改善面部美觀。