灌完腸后如果馬上大便可能會使藥物失去藥效失去原有的作用。
灌腸一般是治療某些腸道疾病如低位結腸疾病或直腸疾病的治療方式，為使藥物直接作用于腸道病變部位，發揮藥物最大的治療效果，這時候就需要把藥物從肛門處灌入腸道，并在腸道內保留一段時間，至少30分鐘，以使藥物更好地吸收。如果灌進去的藥物立馬排出，沒有更好的保留灌腸藥物在腸道內的濃度，藥物不被人體吸收，難以起到理想的作用。所以一般建議灌完腸后不要馬上大便。
如果在灌腸期間出現腹脹或便意的情況，可以通過深呼吸，放松腹肌，以緩解不適。