適度水解奶粉與普通奶粉所用的原料一樣，但適度水解奶粉和普通奶粉主要的區別是蛋白結構和適用人群不同。可以根據孩子的情況以及需求，選擇較為合適的奶粉。
1、蛋白結構：孩子所用的奶粉里主要含有牛奶蛋白的成分，普通奶粉里面含有的牛奶蛋白分子量較大，致敏性較高，對孩子來說比較容易出現過敏。適度水解蛋白奶粉是通過人工的方式，把大分子蛋白進行分解或水解，把致敏性比較高的普通牛奶蛋白分子，水解成致敏性比較低的小分子蛋白質，減少發生過敏的風險；
2、適用人群：普通奶粉適合沒有家族過敏史，身體各項指標都正常的孩子。如果孩子在出生后不能進行母乳喂養，或母乳不足，尤其是父母都有過敏的相關問題，如有過敏性鼻炎、哮喘等疾病，孩子發生過敏的幾率會較高，添加適度水解蛋白奶粉有利于降低孩子發生過敏的風險。
應注意的是適度水解蛋白奶粉，主要作用為預防過敏，如果部分孩子已經發生過敏，出現明顯的過敏相關表現，此時只用適度水解蛋白奶粉可能不行，還需使用深度水解奶粉，甚至是氨基酸奶粉，幫助孩子避免過敏，補充營養。