男性HPV6低危型在一定情況下不一定嚴重。如果是無癥狀感染、免疫力正常且無其他不良情況的情況，通常不嚴重；但如果出現癥狀、免疫力低下或者有其他不良因素等情況，可能比較嚴重。如有異常，需要及時就醫，遵醫囑處理。
在男性HPV6低危型感染早期，如果沒有出現明顯的癥狀，一般而言對身體的影響較小。此時，人體的免疫系統可能能夠有效地控制病毒的復制。然而，如果病毒持續感染，在疾病中期和晚期，可能會引起尖銳濕疣等癥狀。此時需要及時治療，如使用外用藥物鬼臼毒素酊、咪喹莫特乳膏等，其作用是破壞疣體組織。也可以采用物理治療，如激光治療、液氮冷凍治療等，其原理是利用高能量的激光治療束或液氮的低溫使疣體組織壞死脫落。
男性HPV6低危型感染患者應注意個人衛生，避免同房傳播病毒。增強免疫力，定期復查。如果出現癥狀，應及時就醫治療。