咳嗽時腰疼可能是急性支氣管炎、肺炎、胸膜炎、氣胸、肺栓塞等原因導致的，患者需要及時到醫院就診，并且配合醫生對癥治療。
1、急性支氣管炎：病毒或細菌感染引發急性支氣管炎，咳嗽劇烈時可牽涉腰部肌肉引起疼痛。患者應注意休息、多飲水。可按照醫囑使用右美沙芬片、噴托維林片等藥物進行治療。
2、肺炎：細菌、病毒、支原體等病原體感染肺部導致肺炎，頻繁咳嗽使腰部肌肉疲勞而疼痛。患者需注意室內通風，可以按照醫囑使用阿奇霉素片、頭孢克肟膠囊等藥物進行治療。
3、胸膜炎：結核菌感染或其他病原體感染等引起胸膜炎，咳嗽時胸膜受牽拉，同時腰部肌肉緊張引發疼痛。患者要避免劇烈運動，可以按照醫囑使用異煙肼片、利福平膠囊等藥物進行治療。
4、氣胸：肺部組織異常導致氣體進入胸腔形成氣胸，咳嗽時胸腔壓力變化及腰部肌肉代償性緊張導致疼痛。患者應避免劇烈咳嗽，可以按照醫囑使用布洛芬緩釋膠囊、雙氯芬酸鈉腸溶片等藥物進行治療。
5、肺栓塞：血栓脫落后栓塞肺動脈引發肺栓塞，咳嗽時身體的應激反應可引起腰部疼痛。患者應避免長時間臥床，可以按照醫囑使用華法林鈉片、利伐沙班片等藥物進行治療。
患者需要注意休息，避免過度勞累。