腳趾甲出現兩層且下面有新趾甲一般是營養不良、外傷、真菌感染、甲溝炎、某些疾病等原因所致。建議患者及時就醫，在醫生的專業指導下對癥用藥，緩解病情。
1、營養不良：缺乏維生素、礦物質等營養物質，影響趾甲正常生長。此時可在醫生的專業指導下使用多維元素片、葡萄糖酸鋅口服液、魚肝油軟膠囊等藥物來補充營養。
2、外傷：腳趾受到擠壓、碰撞等外傷，導致趾甲受損，新的趾甲在下面生長。針對外傷原因，可在醫生的專業指導下使用三七傷藥片、維生素C片、云南白藥氣霧劑等藥物以消腫止痛。
3、真菌感染：如甲癬，真菌侵入趾甲，破壞趾甲結構。這種情況可在醫生的專業指導下使用伊曲康唑膠囊、阿莫羅芬搽劑、特比萘芬片等藥物以加強抗真菌效果。
4、甲溝炎：趾甲周圍組織發炎，可能影響趾甲生長。治療甲溝炎可在醫生的專業指導下使用頭孢克洛分散片、魚石脂軟膏、連翹敗毒丸等藥物以清熱解毒。
5、某些疾病：如甲狀腺功能減退、銀屑病等，可能導致趾甲異常。對于甲狀腺功能減退，可在醫生的專業指導下使用左甲狀腺素鈉片、阿維A膠囊、卡泊三醇軟膏、復方青黛丸等藥物以緩解不適。
用藥應在醫生的指導下進行，同時注意保持腳部清潔衛生。