一般情況下，新生兒打了卡介苗后哭鬧可能是正常現象，也可能是不良反應導致的。具體分析如下：
1.正常現象：新生兒在打了卡介苗后哭鬧，可能是一種正常的生理現象，因為在手臂上打針的時候，針眼的位置會有疼痛，新生兒對疼痛刺激比較敏感，會出現哭鬧的情況，家長可以將新生兒抱在懷里，輕輕拍打背部，安撫新生兒。
2.不良反應：卡介苗屬于生物制劑，新生兒打了卡介苗后可能會產生一些不良反應，比如發燒、腹痛等，可能會導致新生兒打了卡介苗后哭鬧，家長需要隨時觀察新生兒情況，如果新生兒打了卡介苗后，出現發燒、腹痛的情況，家長應該在醫生指導下及時給新生兒服用對乙酰氨基酚泡騰顆粒、四磨湯口服液等藥物來治療。