HPV59陽性一般可以打九價疫苗，盡管HPV59亞型病毒不在九價疫苗的預防范圍內，但仍然可以接種九價疫苗，以預防其他亞型的人乳頭瘤病毒感染。
九價疫苗的主要目的是預防人乳頭瘤病毒的6型、11型、16型、18型等九個亞型的感染，適合9-45歲的女性使用。目前市場銷售的九價疫苗為基因工程苗，安全性較低，且價格相對昂貴。該方法在預防宮頸、陰道和外陰的部分癌前病變方面，顯示出了一定的預防效果。HPV59呈陽性，這是一種高危型的人乳頭瘤病毒感染，治療時需要使用抗病毒藥物，而在臨床實踐中，重組人干擾素是常用的治療方法。目前在國內應用較多的是滅活疫苗和基因工程活載體疫苗。當存在病毒感染或采用其他藥物治療時，接種九價疫苗可能會削弱疫苗的效果，降低其預防作用，并對抗體生成產生不良影響。因此，對于有病毒感染者要考慮是否打過乙肝疫苗。一般的建議是首先對HPV59感染進行治療，然后進行后續的復查，當檢查結果顯示為陰性時，再接種九價疫苗會更為適宜。
對于HPV59陽性的患者，在治療過程中應避免性行為，以減少感染的風險。按照醫生的建議進行藥物治療可以幫助病毒更快地被消除。如果治療后的檢查結果顯示指標轉為陰性，并且患者的年齡范圍在9-45歲之間，可以接種九價疫苗來降低宮頸癌的發病率。但這并不意味著宮頸癌是絕對不會發生的，因此每年都需要進行常規的篩查工作。