牛黃清胃丸和黃連清胃丸區別在于成分不同，治療的癥狀也不同，可以根據實際情況在醫生指導下選擇合適的藥物進行治療。
牛黃清胃丸和黃連清胃丸都屬于清除胃火的藥物，能夠有效的緩解腹痛、腹脹等癥狀，但是包含的成分不同，牛黃清胃丸的主要成分是人工牛黃、大黃、菊花、麥冬、薄荷、石膏、梔子等，經常用于清除胃火和心火，對于心火過旺引起的頭暈目眩、心悸等癥狀，有較好的治療效果；黃連清胃丸的主要成分有黃連、梔子、連翹、大黃、白芷等，能夠治療肺火過旺和胃火旺盛所引起的口舌生瘡、牙齦腫痛、便秘等癥狀，脾胃濕熱的患者應該吃黃連清胃丸。
藥物治療的同時患者需要在日常飲食上有所調整，建議選擇清淡瀉火的蔬菜和水果，比如絲瓜、苦瓜、黃瓜、柚子、雪梨、橙子等，避免吃油膩、辛辣刺激性的食物。