婦科厭氧菌并不是疾病，但厭氧菌繁殖可能會導致婦科疾病，常見疾病如陰道炎、盆腔炎等。厭氧菌一般缺氧的環境才能生長繁殖，女性的陰道屬于相對封閉的腔道，比較利于厭氧菌的生長和繁殖，在抵抗力差的時候就會造成厭氧菌感染，導致陰道炎，厭氧菌還可以上行感染到盆腔導致盆腔炎。
一、陰道炎：主要癥狀有白帶增多，可呈膿性，感染比較嚴重時陰道壁會有炎性滲出，分泌物可呈漿液性。此時通常會有外陰腥臭味、外陰瘙癢等癥狀，做白帶檢查可以發現桿菌和白細胞，治療上可以用甲硝唑泡騰片放陰道治療，也可以進行臭氧治療。
二、盆腔炎：1、急性盆腔炎：主要癥狀是白帶增多、膿性，伴有下腹部墜脹、疼痛，嚴重者可以有腹膜刺激癥，伴有發熱，食欲不振等癥狀，可以通過婦科雙合診進行判斷，檢查的時候多數有子宮和附件區壓痛。治療上可以采取甲硝唑、頭孢等抗生素聯合進行治療，用藥一般主張足量、療程足夠，以免治療不徹底導致慢性盆腔炎。如果有盆腔積膿或者是包裹性積液，建議在足量抗生素治療的基礎上進行手術治療；
2、慢性盆腔炎：多數癥狀不明顯，只有輕微的下腹部脹痛或者腰酸，部分女性只是偶爾下腹部隱痛，如果是急性發作期，可以有急性盆腔炎的癥狀。慢性盆腔炎盡量選擇在急性期用足量的抗生素治療，抗生素也首選甲硝唑或者奧硝唑聯合頭孢類治療，如果沒有明顯的急性期，可以選擇在月經期用足量的抗生素靜脈點滴治療。月經期的時候盆腔充血，盆腔藥物濃度會比較大，效果較好，可以連續3個月經期進行治療。
婦科厭氧菌感染是比較常見的一種疾病，腸道內厭氧菌也比較豐富，而陰道和肛門比較接近，有時腸道的厭氧菌也容易感染到陰道。大便時如果不注意清潔，也容易導致腸道厭氧菌感染至陰道，引起陰道炎癥和盆腔炎，因此平時要注意保持外陰部清潔衛生，勤洗外陰，勤換內褲，以減少婦科厭氧菌感染。