一般來說，肺癌晚期吃阿法替尼頭皮有膿瘡可以通過日常護理、藥物治療等方式進行處理。具體分析如下：
1.日常護理：如果肺癌晚期患者出現吃阿法替尼頭皮有膿瘡的現象，首先應該注意局部的清潔衛生，避免抓撓或摩擦患處；同時應該避免進食辣椒、洋蔥等刺激性食物，可以多吃新鮮的蔬菜和水果，有助于改善不適癥狀。
2.藥物治療：患者可以按醫囑使用碘伏、過氧化氫溶液等藥物進行消毒殺菌，也可以按醫囑外用紅霉素軟膏、莫匹羅星軟膏等藥物進行抗感染治療。
建議患者在醫生的指導下合理吃阿法替尼，如果出現不良癥狀，及時前往醫院就診治療。