左手小指第二關節痛的原因有很多，如指關節韌帶拉傷、指骨骨折、類風濕關節炎等。
1、指關節韌帶拉傷：主要原因為手指過度活動導致關節周圍韌帶拉傷，可因拉扯重物、打籃球、摔倒后手撐地等原因導致，部分患者表現為左手小指第二關節疼痛腫脹，活動后疼痛加劇。
2、指骨骨折：小指骨質較細，容易在外力的作用下骨折，如患者有外傷史，如摔傷、打擊傷等，可造成左手小指骨骨折而引發第二關節疼痛，具體表現為小指活動受限、腫脹畸形，可伴有局部瘀血、瘀斑等。
3、類風濕關節炎：是一種慢性全身性自身免疫性疾病，其特征是手、足小關節的多關節、對稱性、侵襲性炎癥，經常伴有關節外器官受累及血清類風濕因子陽性，具體表現為小指關節僵硬疼痛，早上起床時僵硬程度加重，伴有小指關節周圍紅腫，通常為雙側對稱發病，也可導致左手小指第二關節痛。