如果檢測α-L-巖藻糖苷酶低，可能是因為體內該酶缺乏或活力降低，可以見于遺傳因素、結束妊娠、一過性糖蛋白或糖酯代謝混亂、進行性錐體營養不良等情況。
1、遺傳因素：可能是由于先天性因素導致組織器官、體液中的α-L-巖藻糖苷酶缺乏或活力降低，出現α-L-巖藻糖苷酶偏低，若自身不伴有其他癥狀，一般無需進行特殊處理。
2、結束妊娠：相關研究表明，在妊娠期間，隨著激素水平的變化，女性體內的血清中α-L-巖藻糖苷酶，會隨孕期的增加逐漸升高。當妊娠結束后，激素水平逐漸恢復正常，α-L-巖藻糖苷酶也會逐漸下降，屬于正常情況。
3、一過性糖蛋白或糖酯代謝混亂：α-L-巖藻糖苷酶是一種溶酶體酸性水解酶，主要參與含巖藻糖基的各種糖脂、糖蛋白、黏多糖等大分子物質的分解代謝。如果發現該酶一過性偏低，沒有明顯的不適癥狀，此時沒有臨床意義，通常不用特殊處理，只需定期體檢即可。
4、進行性錐體營養不良：當機體攝入營養不足時，會導致能量不足，影響各種酶的生成和代謝，會造成α-L-巖藻糖苷酶指標偏低。此時建議患者及時補充營養，多吃高蛋白的食物，比如牛奶、雞蛋等，必要時可以遵醫囑使用復方營養混懸劑、腸內營養混懸液(TPF)等，補充營養。
除上述情況外，還可見于胰腺功能損傷、慢性肝炎、囊性纖維變性伴發胰腺炎、卵巢腫瘤、肝硬化、肝癌等情況，需要進一步完善影像學檢查，明確診斷。如果出現異常，應早發現、早治療。