睡覺時喉嚨不舒服，可能是環境、睡覺習慣等非病理性因素造成的，也可能是咽喉疾病、鼻腔堵塞等病理性因素導致的，建議患者及時就醫，做鼻腔CT、喉鏡、醫生查體等相關檢查，明確病因后采取針對性治療。
一、非病理性因素
1、環境：可能是因為患者居住的環境過于干燥，處于空調房，或寒冷干燥的冬季，夜晚經常關窗睡覺，導致空氣不流通，環境缺乏水汽，導致患者在夜晚時會出現喉嚨干癢、疼痛等不適癥狀。通過開窗通風、使用加濕器等方法，可以緩解癥狀。
2、睡覺習慣：患者在睡覺時可能喜歡用被子將頭埋住，導致睡覺時鼻子不通暢，從而用口腔呼吸，使咽喉黏膜變得干燥，出現喉嚨不舒服的現象。患者通過改善睡覺習慣，或睡前用封唇貼貼住雙唇，可以緩解不適癥狀。
二、病理性因素
1、咽喉疾病：患者可能是患有咽喉疾病，如慢性咽炎、扁桃體炎等，因為病毒、細菌等侵入咽喉，導致咽喉出現炎癥反應，從而引發咽喉疼痛的現象，在睡覺時咽喉不舒服的癥狀會加重。建議患者及時就醫，可遵醫囑使用阿莫西林膠囊、頭孢克洛顆粒等消炎藥治療，緩解不適癥狀。
2、鼻腔堵塞：患者也可能是患有鼻竇炎、鼻腔腫瘤等疾病，導致鼻腔堵塞，不能使用鼻子呼吸，患者因為長期用口腔呼吸，造成咽喉干癢、疼痛，在夜晚時也會出現。建議患者及時就醫診治，鼻竇炎患者可以使用鹽酸左西替利嗪片、羅紅霉素分散片等藥物治療。如果是鼻腔良性腫瘤或早期惡性腫瘤，應及時采取手術治療，積極配合醫生，如果是中晚期鼻腔惡性腫瘤，可以通過手術、化療、放療等方法改善。
建議患者保持睡眠環境開窗通風，干凈衛生，盡量處于舒適的環境中睡覺，保證睡眠質量。