流行性乙型腦炎是一種由于乙型腦炎病毒感染，所危害到腦部實質的傳染性疾病，常累及丘腦、腦干等部位，不易累及的部位，也就是病變最輕的部位，通常為脊髓，其他非神經組織往往也不會受到影響。
乙腦病毒主要通過蚊蟲叮咬進行傳播，具有嗜神經性，因此其感染部位主要集中在神經中樞。當人體被帶有乙腦病毒的蚊蟲叮咬后，病毒經過毛細血管或者淋巴管，被血液運輸到單核巨噬細胞系統進行繁殖，然后進入血循環，隨著血液運輸到大腦部位，導致患者出現病毒血癥，同時侵入血管內膜及各靶器官，臨床通過CT、MRI等影像學檢查發現，流行性乙型腦炎發病時，最嚴重的部位集中在丘腦、中腦等部位，其中包含呼吸中樞、體溫調節中樞等，因而經常出現體溫升高、呼吸困難等情況，大腦頂葉、額葉、海馬體等部位往往也發生明顯病變，但脊髓相對受影響較重，因而在神經系統中，流行性乙型腦炎不易累及脊髓。而由于其具有嗜神經性，因此通常不對非神經組織進行侵襲，也不易累及大腦、脊髓以外的部位。
流行性乙型腦炎對于早期的患者，可以遵醫囑服用廣譜抗病毒藥物，如利巴韋林顆粒、阿昔洛韋片等治療，流行性乙型腦炎患者還應嚴密觀察病情，及時護理，應隔離于有防蚊設備的病室內，病室環境宜安靜、陰涼、通風。