晨起拉肚子不是結腸癌的特異性癥狀，并不能說明是結腸癌所致，相對而言晨起拉肚子是功能性消化不良、腸易激綜合征、慢性結腸炎等疾病的可能性大。
1、功能性消化不良：可表現為上腹痛、上腹脹、早飽、噯氣、腹瀉等一系列不適癥狀，同時不伴有器質性病變，部分患者也可發生晨起拉肚子的情況；
2、腸易激綜合征：包括腹瀉型、便秘型，其中腹瀉型可表現為晨起拉肚子，特別是在進食剛開始或結束時出現突發性腹瀉。患者大便多呈稀糊狀，部分患者腹瀉與便秘交替發生；
3、慢性結腸炎：發病與過敏、感染等因素有關，主要表現為腹瀉、便秘、腹痛、腸出血等，其中腹瀉是結腸炎最常見的癥狀，多有黏液性血便、水樣便、黏液便，可出現晨起拉肚子的情況。
除了上述疾病以外，潰瘍性結腸炎、克羅恩病等炎癥性腸病，由于慢性病程，常反復發作，難以治愈，腸道黏膜潰瘍、充血等，也可表現為晨起拉肚子。而結腸癌是指發生于結腸部位的消化道惡性腫瘤，其診斷需要依靠結腸鏡、腹部增強CT等檢查，有可疑情況時也可以考慮做磁共振檢查分析。晨起拉肚子等腹瀉癥狀并非結腸癌典型癥狀，患者還可表現為排便習慣與糞便性狀的改變，或伴有血便或大便隱血陽性，部分患者可出現頑固性便秘。此外，結腸癌患者還可出現腹痛，表現為腹部鈍痛，因病變可使胃反射加強，也可出現餐后腹痛。當合并腸梗阻時腹痛癥狀加重或陣發性絞痛，多數患者可發現腹部包塊，晚期可有貧血、低熱、進行性消瘦等全身癥狀。