健康人群腸道正常菌群以大腸埃希菌、厭氧桿菌、腸球菌等為主，菌量和菌譜處于相對穩定狀態，保持著細菌與宿主間的生態平衡。若小腸細菌過度生長，可導致腸道菌群失調，引起腹瀉、腹痛、腹脹、腸鳴等癥狀。
1、Ⅰ度腸道菌群失調：細菌總數在正常低值，革蘭陽性桿菌較正常略減少，而革蘭陰性桿菌稍有增加，可出現輕微排便后不適、便秘、腹瀉等癥狀；
2、Ⅱ度腸道菌群失調：細菌總數較正常明顯減少，革蘭陽性桿菌顯著減少，革蘭陰性桿菌如擬桿菌、大腸埃希菌等明顯增多，革蘭陽性球菌如鏈球菌、葡萄球菌等較正常增多，可引起食物消化不良，出現餐后飽脹、腹部疼痛等癥狀；
3、Ⅲ度腸道菌群失調：細菌總數極少，革蘭陽性、革蘭陰性桿菌大量消失，類酵母樣菌或葡萄球菌占優勢，易引起腸道感染，如感染性腸炎，或出現早飽感、食欲減退、噯氣、反酸、腹脹等癥狀。
腸道菌群失調時，注意飲食清淡，可在醫生指導下服用益生菌、益生元等調節腸道菌群，改善腸道微生態環境，緩解腸道不適癥狀。