抗原是陰性指新型冠狀病毒抗原檢測呈陰性，沒有感染新型冠狀病毒，核酸異常指新型冠狀病毒核酸檢測出現異常，可能感染了新型冠狀病毒。如果出現新型冠狀病毒抗原檢測結果與新型冠狀病毒核酸檢測結果不一致的情況，考慮是病毒含量較少、處于潛伏期、操作失誤等因素導致的。
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1、病毒含量較少：新型冠狀病毒抗原檢測的敏感度，較新型冠狀病毒核酸檢測低一些，如果人體內新型冠狀病毒含量較少，新型冠狀病毒抗原檢測可能會檢測不出來，出現陰性的情況，但是去做新型冠狀病毒核酸檢測又檢測到病毒，出現陽性的情況。
2、處于潛伏期：新型冠狀病毒進入人體后會有一段潛伏期，在前期時可能檢測不出來，如果先做的新型冠狀病毒抗原檢測，處于潛伏期，難以檢測出來；之后再做的新型冠狀病毒核酸檢測，此時潛伏期已過，又能檢測新型冠狀病毒。
3、操作失誤：新型冠狀病毒抗原檢測和新型冠狀病毒核酸檢測有小概率可能會出現試驗誤差，操作不當、天氣寒冷等因素，都可能會導致假陰性或假陽性的情況。
如果出現新型冠狀病毒抗原檢測結果與新型冠狀病毒核酸檢測結果不同的情況，建議以新型冠狀病毒核酸檢測結果為準，或到醫院做更完善的檢查，明確自身是否感染新型冠狀病毒。