通常情況下，甲狀腺癌和淋巴瘤哪個更難治不可一概而論，需根據疾病分期以及類型而定，甲狀腺癌和淋巴瘤如果嚴重應及時就醫。甲狀腺癌一般采用手術治療的方式治療，在術后服用甲狀腺素來抑制TSH封閉，如果是乳頭狀或者濾泡狀甲狀腺癌，那么預后往往是很好的，通過手術大部分是可以治愈的。而如果是未分化癌的話，多數情況下發現時就已經出現了遠處的轉移，治療起來比較困難，且預后是很差的。
另外，淋巴瘤一般不進行手術治療，多采用化療、放療或骨髓或造血干細胞移植等綜合治療。如果淋巴瘤是霍奇金淋巴瘤，通常情況下預后是比較好的，治愈的可能性很大。如果是非霍奇金淋巴瘤中的惡性程度很高的類型，比如伯基特淋巴瘤，治療起來是比較困難的，預后是很差的。