通常情況下，母乳性黃疸和病理性黃疸的區別有原因、癥狀、持續的時長。
1.原因：母乳性黃疸主要由母乳喂養引起。而病理性黃疸一般與新生兒溶血病、新生兒感染、膽道先天性畸形等因素有關。
2.癥狀：母乳性黃疸的寶寶主要表現為皮膚黃染，一般無其他明顯不適。病理性黃疸除了皮膚、鞏膜等黃染外，通常還伴隨出現嗜睡、吮乳困難、兩目斜視、四肢強直等癥狀。
3.持續的時長：寶寶如果為母乳性黃疸，一般在出生1周后出現，2周左右達高峰后，逐漸下降，并且停止母乳24-48小時，嬰兒黃疸的情況通常能明顯減輕。病理性黃疸的寶寶通常在出生后24小時內出現黃疸，一般超過2-4周，并且呈進行性加重。
此外，還存在治療方式、預后等方面的區別。