性別認知障礙一般指性別認同障礙，通常情況下，性別認同障礙是心理疾病。
性別認同障礙是指一個人在心理上不能認同自己的生理性別，認為自己應(yīng)該屬于另一個性別，渴望轉(zhuǎn)換。通常情況下，性別認同障礙是心理疾病，其發(fā)病可能與遺傳、激素異常、身體發(fā)育異常、家庭和社會環(huán)境等有關(guān)。患者主要表現(xiàn)為強烈而持續(xù)認同異性的性別，對自己的性別持續(xù)感覺煩惱，一般癥狀至少持續(xù)6個月。患者一般可以通過激素治療、手術(shù)治療、心理治療等方法來處理。對于激素治療，男性患者可以按醫(yī)囑使用雌激素、黃體激素等來治療，女性患者可以按醫(yī)囑使用雄激素來治療；對于手術(shù)治療，一般可以采取性別重塑術(shù)；心理治療一般是協(xié)助患者探索性別的問題，以此來緩解患者的性別認同障礙。