牙齦瘤切除后牙齦有個窟窿，實際上通常是由于手術導致的局部牙齦組織缺損，屬于術后的正常現象，一般不必特殊治療。繼續后續處理即可，比如使用牙周塞治劑保護創面，定期換藥等。
牙齦瘤是發生在牙齦乳頭部位的炎癥反應性瘤樣增生物，發病主要與牙菌斑、牙結石、不良的修復體等物質對局部的刺激，還可能與患者內分泌改變有關。大多需要通過手術切除的方法來進行治療，手術切除需徹底，否則復發率會增高。在手術過程中，需要將牙齦瘤的瘤體組織連同骨膜完整切除，還要刮除相應部位的牙周膜，所以牙齦瘤切除后就會發現牙齦局部有個窟窿，實際是手術造成的局部牙齦組織缺損，一般可逐漸愈合。手術結束之后需要局部隔濕干燥，然后使用牙周塞治劑保護創面，定期復查并行消毒換藥處理，促進愈合。待創面沒有紅腫、疼痛、出血癥狀時，便可以去除牙周塞治劑。隨著時間的延長，局部會有一定程度的改善。
部分牙齦瘤患者即使行手術治療，未來也有復發的可能性，復發后還需要再次進行牙齦瘤切除手術。如果復發次數較多，甚至已經導致了牙齒的松動，則需要將患牙拔除。