灰指甲甲床凸起的肉一般可以通過局部用藥和口服藥物改善，必要時可以通過手術治療，具體的方法需要根據自身的情況決定。
1、局部用藥：灰指甲甲床凸起的肉可能是受到真菌感染或繼發細菌感染，導致局部因為炎性反應而增生，一般需要通過使用碘伏或者是雙氧水對局部做消毒處理，并外用硝酸酮康唑乳膏、莫匹羅星軟膏等藥物控制感染，有利于炎癥的消退；
2、口服藥物：如果癥狀比較嚴重，局部用藥效果有限，需要聯合口服藥物改善，加強抗感染的治療效果。比如真菌感染可口服特比萘芬、伊曲康唑等，繼發細菌感染可口服頭孢克肟或阿莫西林。但是藥物的具體使用方法和劑量一定要謹遵醫囑，不要盲目使用；
3、手術治療：如果凸起的肉出現了明顯的膿腫，甚至還伴隨著膿性分泌物，一般需要通過切開引流治療，避免出現蜂窩織炎、骨髓炎等疾病。
恢復期間要避免長時間行走，還需要多穿寬松或者是透氣性比較好的鞋襪，保持腳部干燥。同時還需要注意飲食調整，以清淡易消化的食物為主，不建議進食辛辣刺激性食物。