一般情況下，高三女孩肚子疼、喉嚨疼可能是反流性食管炎、胃腸炎、扁桃體炎等原因導致的，需要對癥治療。具體分析如下：
1.反流性食管炎：如果高三女孩平時生活習慣不良，長期暴飲暴食容易導致反流性食管炎，造成胃酸分泌過多，容易反流進入咽喉，進而出現肚子疼、喉嚨疼的情況，高三女孩可以在醫生的指導下使用西沙必利片、氨芐西林膠囊、雷貝拉唑鈉腸溶片等藥物進行治療，生活中注意適當運動以增強體質。
2.胃腸炎：如果高三女孩吃了不干凈的食物、腹部著涼等原因，可能會引發胃腸炎，胃腸炎發作時往往會造成肚子疼，病情嚴重時，受到炎癥刺激，還會導致喉嚨不適，因此，高三女孩肚子疼、喉嚨疼可能是胃腸炎造成的。高三女孩需要在醫生的指導下通過藥物治療，如顛茄片、阿莫西林膠囊、消旋山莨菪堿片等，生活中注意飲食清淡。
3.扁桃體炎：如果高三女孩吃了生冷、辛辣、刺激的食物，并且沒有及時補充水分，刺激上呼吸道，可引發扁桃體炎，炎癥刺激下可能會引起喉嚨疼，甚至會造成肚子疼。高三女孩可以在醫生指導下吃青霉素V鉀膠囊、阿奇霉素片、頭孢克洛緩釋片等藥物進行治療，生活中注意保持口腔衛生。