寶寶醒著的時候搖頭可能是出汗、皮疹、缺鈣等因素引起的，家長可以帶寶寶到醫院就診，查明病因，在醫生指導下對癥治療。具體內容如下：
1.出汗：如果寶寶醒著的時候活動量過大，可能會導致出汗，并且衣物較多的情況下，就可能會造成寶寶身上癢，導致寶寶醒著的時候搖頭。家長可以及時給寶寶洗澡，保持寶寶身體干燥，可以緩解寶寶癥狀。
2.皮疹：如果寶寶接觸了刺激性物品，發生皮疹，可能會導致寶寶身體瘙癢、紅腫等癥狀，寶寶不能用語言表達，可能會通過搖頭的方式表達身體不舒服的意思。家長可以在醫生指導下給寶寶使用爐甘石洗劑、氧化鋅軟膏、地奈德乳膏等藥物進行治療。
3.缺鈣：寶寶身體處于快速發育的階段，如果寶寶缺鈣，身體生長需求得不到滿足，可能會引起寶寶醒著的時候搖頭的癥狀。家長可以在醫生指導下給寶寶服用葡萄糖酸鈣口服溶液、碳酸鈣顆粒、葡萄糖酸鈣片等藥物補鈣。