多囊腎和多囊肝是基因異常所致，此類患者服用中藥可以適當緩解癥狀。通常可以遵醫囑應用疏肝益腎類中藥、活血化瘀類中藥、清利濕熱類中藥進行治療。患者體質不同，既可以選擇單一治療原則，也可以選擇多種藥物聯合應用，以保證治療效果。
1、疏肝益腎類中藥：中醫認為肝和腎都屬于人體的代謝器官，因此當肝、腎功能失常，人體排毒功能則會受到影響，進而出現多囊腎和多囊肝。通常以疏肝益腎為治療原則，具體方劑有柴胡疏肝散、六味地黃丸、丹梔逍遙散、知柏地黃丸等；
2、活血化瘀類中藥：氣血濁毒瘀阻不通，便會沉積體內，進而出現多囊腎和多囊肝。因此，患者應遵醫囑應用血府逐瘀湯、少腹逐瘀湯、復元活血湯、桃紅四物湯等，以活血化瘀、益氣養血，也能夠起到良好的治療作用；
3、清熱利濕類中藥：濕熱內阻、濁毒留滯也會出現多囊腎和多囊肝，通常可以遵醫囑應用龍膽瀉肝湯、知柏地黃丸等，以疏肝益腎、清熱利濕，對于因濕熱內阻造成的多囊腎和多囊肝具有良好的治療作用。