孕3個月下腹部隱隱作痛，如果僅為輕微疼痛，無陰道流血，可能為正常的生理現象，如果疼痛加重，或者伴有陰道流血，需要警惕先兆流產、異位妊娠。如果孕前存在卵巢囊腫，可能是卵巢囊腫蒂扭轉導致的疼痛。除此之外還可能由于腸道疾病，如消化不良、急性胃腸炎等疾病導致。孕3個月下腹部隱隱作痛，需要盡早就診，如為病理性原因需針對病因進行處理。
一、生理性疼痛：懷孕后子宮增大，子宮肌纖維、韌帶受牽拉，或者周圍臟器受到壓迫，可導致下腹部隱隱作痛，初次妊娠的孕婦多見。疼痛一般在憋尿或活動過多時易出現，多為正常生理現象，休息后可緩解，不必過于擔心。孕婦應注意休息、規律作息，避免重體力勞動，定期產檢。
二、病理性疼痛：1、先兆流產：如果下腹感到一陣陣的收縮疼痛，同時伴有或不伴有陰道出血，需考慮先兆流產。孕婦需要注意休息，避免過多的活動，同時忌性生活，應及時前往醫院進行保胎治療，可以口服地屈孕酮或注射黃體酮，進行保胎治療，如果治療后腹痛仍然加劇、陰道流血增多，提示流產不可避免，此時需要進行手術治療，如清宮術和刮宮術；
2、異位妊娠：如果未通過孕檢確認胚胎在宮內，此時腹痛不排除異位妊娠的可能性。異位妊娠通常疼痛較為劇烈，伴有顏色黯紅的不規則陰道出血，癥狀較重者可能導致腹腔內大量出血而造成失血性休克，此時需要進行手術治療；
3、消化不良：除下腹部隱隱作痛外，還可能伴有腹脹、噯氣、惡心等表現，可使用多潘立酮、莫沙必利等促胃動力藥，促進消化。孕婦平時應注意飲食，少吃肥肉、奶油等不易消化的食物，多進食新鮮的蔬菜、水果，多運動、多飲水；
4、急性腸胃炎：大多數會伴隨有惡心、嘔吐、腹瀉、發熱等不適癥狀，一般經過補液、充分休息后可自愈，腹瀉較重者可使用蒙脫石散進行止瀉，如有細菌感染，可遵醫囑使用頭孢曲松鈉等副作用較小的抗菌藥物進行治療。