一般來說，孩子進行三伏灸的時間以10-20分鐘為宜，如果出現不適癥狀，可以前往醫院針灸科就診，明確診斷后，在醫生指導下進行針對性治療。
年齡較小的孩子，比如3-6歲，每次艾灸的時間可以控制在10-15分鐘，因為皮膚更為敏感，身體對熱量的吸收和反應也較為迅速，過長時間的艾灸可能會導致皮膚灼傷或引起不適。隨著孩子年齡的增長，如7-12歲，每次艾灸的時間可以適當延長至15-20分鐘，但如果孩子體質較弱，或者正在患病期間，艾灸時間則應相應縮短，以免加重身體的負擔。
艾灸的部位也會影響時間。如果是在頭面部、胸部等較為敏感的部位進行艾灸，時間應相對較短，而在背部、腹部、腿部等肌肉較為豐厚的部位，時間可以稍長一些。
需要注意的是，在給孩子進行三伏灸的過程中，要密切觀察孩子的反應，如果孩子表示有灼痛感、皮膚出現明顯的發紅，甚至起皰，應立即停止艾灸。同時，三伏灸雖然對孩子的健康有一定的益處，但也不能過度依賴，應結合孩子的日常飲食、運動和作息等方面，全面提升孩子的身體素質。
在日常生活中，不要在孩子饑餓或剛吃飽后進行艾灸，以免引起身體不適，注意室內通風，但要避免孩子直接對著風口，防止受風著涼。