中醫學認為，孩子生下來可能帶有所謂的胎毒，容易導致孩子長痘、長疥瘡、生痤瘡、黃疸等，因此，部分地區流行在孩子生下來后喝黃連水，有助于排毒。需要注意的是，孩子生下來后喝黃連水其實是一種風俗習慣，并沒有權威的科學依據，孩子生下來并非一定要喝黃連水。
黃連性質偏涼，可清熱燥濕、瀉火，孩子剛生下來時，胃腸功能還不成熟，如果不顧孩子體質就喂黃連水，有可能導致孩子不適。并且喝黃連水非但無法預防黃疸，而且因為黃連含有黃連素，會置換已經與孩子體內蛋白質結合的膽紅素，進而可能發生急性溶血性黃疸，若膽紅素進入腦部，則會引起腦核黃疸。此外，孩子剛生下來時，味覺發育還不完全，對苦澀與甘甜的感覺并不靈敏，因此通過喝黃連水證明“吃得苦中苦，方為人上人”的方法并不可靠，這主要是對孩子的一種主觀上的美好祝愿。
如果孩子患有膿腫、濕疹、中耳炎等疾病，可以在醫生的指導下，謹慎使用黃連水來治療疾病。