九價HPV疫苗打完兩針懷孕后，第三針需暫緩接種，待分娩后再補打通常有效果，女性應在醫生的指導下用藥。
九價HPV疫苗是通過激發機體免疫系統產生抗體來預防HPV感染。前兩針已使機體對HPV病毒的部分亞型產生了一定免疫應答，雖未完成完整免疫程序，但已啟動免疫記憶。懷孕時，由于體內激素水平和免疫狀態改變，繼續接種可能對胎兒產生潛在風險，如影響胎兒發育。分娩后按照醫囑補打第三針，可重新激活免疫記憶細胞，刺激機體產生足夠抗體，達到預防相應HPV亞型感染的目的。
女性在懷孕期間，要避免接種各類疫苗，定期進行產檢，密切關注胎兒發育情況。女性在接種后需在現場留觀一段時間，觀察是否有不良反應，如發熱、局部紅腫疼痛等，若有異常及時告知醫生。