通常不存在“最好”的說法。肺癌、乳腺癌、大腸癌這三種癌癥進行靶向治療的效果通常比較好。
1、肺癌：靶向治療是使用靶向藥物來抑制或殺滅癌細胞的治療方法，能夠瞄準變異基因及其代謝物。而在臨床上，肺癌患者常有EGFR基因突變、ALK融合突變等情況，能夠通過靶向治療作用于這些驅動基因，阻斷其信號傳導通路，在不影響正常細胞的前提下，抑制癌細胞，起到較好的治療效果。
2、乳腺癌：該病癥是由乳腺上皮細胞增殖失控所引起的，患者體內可能存在人表皮生長因子受體-2高表達的情況，比較適合進行靶向治療，能夠通過使用靶向藥物來特異性結合于人表皮生長因子受體-2的細胞外配體結合段，進而阻斷配體受體雙聚體的形成，干擾乳腺上皮細胞增殖，抑制腫瘤細胞生長。
3、大腸癌：該病癥是臨床上較為常見的消化道惡性腫瘤，部分患者可能存在Kras、Nras或BRAF基因突變的情況，可作為靶向治療的靶點，在治療過程中出現比較好的效果。因為靶向藥物能夠作用于這些基因突變點，以抗血管生成，阻斷腫瘤的營養供應，進而抑制和殺滅癌細胞。
此外，靶向治療對于胃癌、白血病等疾病通常也有比較好的治療效果。如果已經明確患癌，建議患者完善基因檢測，明確是否存在致病分子靶點。若可見靶點，通常可以遵醫囑進行靶向治療，在治療期間，患者應保持良好心態，如果有不適癥狀，應及時告知醫生。