復方肝素鈉尿囊素凝膠可以直接涂抹在皮膚的表面，能起到淡化痘印的效果，但并不能夠徹底去除。若想去除痘印，可選擇激光手術的方法進行治療。
復方肝素鈉尿囊素凝膠主要是用于治療增生性瘢痕或瘢痕疙瘩，如手術或者燒傷、痤瘡等多種因素留下的瘢痕，可以直接將復方肝素鈉尿囊素凝膠涂抹在皮膚的表面，從而起到一定的效果。復方肝素鈉尿囊素凝膠對于改善痘印只能起到輔助的作用，能夠使痘印逐漸淡化，但是通常無法達到完全去除痘印的效果。
痘印一般分為紅色痘印和黑色痘印。 紅色痘印的形成是因為長痘痘時炎癥導致真皮層中的毛細血管擴張或增生，痘痘消退后，炎癥未完全消失，毛細血管通透性尚未完全恢復至原來的狀態，表現為暫時性紅印。針對紅色痘印，需要做到嚴格防曬，防止組織內黑色素異常沉淀進而發展為黑色痘印，可外用藥膏，如復方肝素鈉尿囊素凝膠、阿達帕林凝膠等，還可進行廣電治療，比如光子嫩膚、點陣激光等。而黑色痘印是炎癥期間，黑素細胞受到刺激，沉積在表皮或真皮層，去除方法主要是抑制黑色素形成，加速黑色素代謝，可選用化學剝脫術、點陣激光等進行治療。