指甲上有小點點像針孔的處理方式，需要根據具體原因選擇，常見的原因有甲營養不良、甲癬、銀屑病等。
1、甲營養不良：甲營養不良通常是缺乏微量元素或各種維生素引起的，微量元素和維生素參與指甲的生長代謝，缺乏后可能會導致指甲變脆、出現白點等癥狀。平時可以多吃含微量元素或各種維生素的食物緩解，如雞蛋、豬肝、蘋果、核桃等。
2、甲癬：甲癬是由皮癬菌、酵母菌等真菌引起的，在真菌的刺激下，容易引起指甲增厚、變形，甲蓋上出現小點的癥狀。建議及時遵醫囑服用鹽酸特比萘芬片、鹽酸伊曲康唑膠囊等藥物進行治療，通過抑制真菌氧化酶活性，能起到抗菌的作用。
3、銀屑病：該疾病可能會導致指甲表面出現異常結構，增生針孔大小的小點。可以遵醫囑外用丁酸氫化可的松乳膏、鹵米松乳膏、地奈德乳膏等藥物治療，可以調節炎癥反應，起到抗炎、減少滲出的作用。
此外，該情況也可能是慢性胃炎、慢性胰腺炎、腎性貧血、蛔蟲感染等原因引起的，建議及時就診治療。平時要注意指甲的干凈衛生，定期修剪。