一般情況下，畢Ⅰ和畢Ⅱ式術后的并發癥包括術后出血、胃腸功能紊亂、營養不良等，需要積極進行對癥治療。
1、術后出血：畢Ⅰ和畢Ⅱ式術都需要大面積切除胃部，術后吻合口容易有出血的情況，患者可能會出現咯血、便血等癥狀，一般不需要特殊治療，隨著身體的恢復會逐漸自行緩解。
2、胃腸功能紊亂：術后患者的胃腸蠕動需要較長時間才能恢復，在此期間容易出現胃腸功能紊亂的情況，引起腹脹、便秘等癥狀，建議患者遵醫囑服用枸櫞酸莫沙必利片、多潘立酮片等促進消化的藥物進行治療。
3、營養不良：胃部大部分切除后，可能會影響到營養的吸收，患者可能會出現面色蒼白、乏力等癥狀，建議患者遵醫囑服用復合維生素B片、維生素C片等補充營養的藥物進行治療。
除此之外，患者還可能會出現膽汁反流性胃炎、吻合口潰瘍、腸梗阻等并發癥，需要積極進行治療。