腦脊液檢測對于神經梅毒具有很高的特異性，一般可以通過腦脊液細胞數量、腦脊液蛋白、腦脊液含糖量、梅毒的特異性抗體檢測、聚合酶鏈式反應檢測等，幫助確定病因。
1、腦脊液細胞數量：神經梅毒患者的腦脊液中，細胞數量會明顯增多，其中以淋巴細胞數量增多為主。在腦脊液細胞學中表現為淋巴細胞樣炎癥，可見漿細胞和單核細胞。同時，腦脊液檢測中白細胞明顯升高，如果白細胞升高＞5μL，則提示可能有神經梅毒。
2、腦脊液蛋白：若患有神經梅毒，則在腦脊液檢查中會出現腦脊液蛋白含量升高的現象。如果蛋白含量＞90mg/100ml，則提示可能有神經梅毒。
3、腦脊液含糖量：若患有神經梅毒，則腦脊液檢查中腦脊液含糖量會呈現正常或降低的現象。
4、梅毒的特異性抗體檢測：在腦神經梅毒中查的是FTA-ABS實驗，如果FTA-ABS實驗陽性，就可以診斷有神經梅毒。
5、聚合酶鏈式反應檢測：可以用腦脊液去做PCR檢測，查看是否能查到螺旋體的RNA。如果檢測到螺旋體RNA，則表明存在神經梅毒。
若懷疑患有神經梅毒，應及時就醫并遵醫囑進行相應檢查和治療。