一般情況下，黃連上清丸和清胃黃連丸的區別有成分、功效等，具體分析如下：
1.成分不同：黃連上清丸主要是由黃連、連翹、梔子、防風、連翹、黃芩等成分組成的；清胃黃連丸主要是由知母、牡丹皮、玄參、地黃、天花粉、赤芍等成分組成，兩者的成分有所不同。
2.功效不同：黃連上清丸一般具有散風止痛、清熱通便等功效，用于治療咽喉紅腫、大便干燥、上焦內熱等癥狀；清胃黃連丸一般具有解毒消腫、清胃瀉火等功效，用于治療肺胃火盛引起的齒齦腫痛、口舌生瘡等癥狀，兩者的功效有所不同。
需注意的是，對黃連上清丸、清胃黃連丸有過敏反應的患者不宜服用相應藥物，患者需在醫生指導下進行用藥。