長期吃烤箱烤地瓜的危害主要是會對胃腸產生一定的影響，誘發消化不良，比較嚴重時可能還會對身體健康造成嚴重的威脅。如果本身患有胃潰瘍或者胃腸道脹氣，長期食用烤箱烤的地瓜之后，可能會使胃酸產生量增多，導致胃脹和打嗝，甚至出現明顯的胃部疼痛以及胃部灼燒感等不良癥狀，盡管烤地瓜比較容易消化和吸收，但地瓜當中含有一種氧化酶，在胃腸道當中會產生一定量的氣體，而且還含有大量的膳食纖維，尤其不要在空腹時食用，空腹時食用烤箱烤的地瓜會增加胃酸分泌，對胃黏膜造成一定的影響，出現消化不良的癥狀影響到正常的胃腸道功能。
另外，地瓜當中的含糖量較高，尤其是用烤箱烤地瓜之后，里面的糖分的濃度會增加，長期食用之后可能會導致身體出現肥胖的癥狀，使身體變得比較的臃腫。因此，日常生活中，建議大家不要長期食用烤箱烤的地瓜，適量食用即可。