一般未遵醫囑長期吃六味地黃丸對身體有害。
六味地黃丸含有的某些成分性偏寒涼，長期或不適宜的服用量可能導致脾胃功能受抑，引起諸如腹部不適、腹瀉等消化問題。并且該藥主要用于滋陰，若在腎陰已補足或非腎陰虛體質的情況下繼續服用，可能引起體內陰陽失衡，表現為寒象加重，如感到格外怕冷、精力衰退等。
需注意，任何藥物的連續使用都會涉及肝臟代謝，長期服用六味地黃丸，盡管旨在補益肝腎，也可能在不當使用下增加肝腎的代謝負擔，極少數情況下影響到肝腎功能。為確保用藥既對癥又安全，需注意在醫生指導下進行，并且注意養成健康的生活習慣。